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华中农业大学自然遗传学:构象染色体捕获新技术

来源:365bet体育在线开户日期:2019-10-05 11:29 浏览:
Hi-C技术是3D基因组学的主要研究方法,但具有实验成本高,数据噪声大,实验过程复杂的缺点。
华中农业大学的研究人员最近发表了一篇题为《捕获染色体构象的高效,低成本的消化结扎方法》的文章。背景数据噪声:高质量,低成本访问Hi-C数据。
研究结果发表在4月26日的NatureGenetics中。本文的作者是华中农业大学“古田学者特聘教授”曹瑜教授和李国良教授。第一作者是林达和洪平。
在同一时期,NatureGenetics还发表了一篇评论文章,指出该文章“引领了一种重要的双连接策略,该策略在执行早期质量控制的同时消除了噪音”。
“ Hi-C技术是3D基因组学的主要方法。新的DLOHi-C染色体构象捕获技术使用同步酶消化方法将DNA接头连接到核酸内切酶切口的末端,最后传统上,该酶用MmeI核酸内切酶消化,可恢复固定大小并相互作用的DNA片段,从而显着降低背景数据噪音并获得比Hi-C更高质量的数据。
DLOHi-C技术还可以用于检测染色体易位。
DLOHi-C技术显着降低了全基因组染色体构象捕获实验的成本,简化了实验步骤,显着提高了实验成功率,支持并解决了基因组组装的问题组件功能包括疾病易感基因座,检测染色体结构变异很重要。
这种DLOHi-C技术为分析3D基因组结构提供了一种新的有效方法。
理解作者概况的最流行的单细胞转录组序列:曹宇,男子。
华中农业大学教授,博士生导师,基础兽医学主任,生物医学中心副主任。
《科学报告》杂志社论委员会农业微生物学的主要国家研究人员。
2008年,他在荷兰的分子生命科学中心完成了博士学位论文,并获得了2008年国家学生奖。
2008年至2010年在加利福尼亚州桑福德伯纳姆医学院进行博士后研究。
2010年至2012年在冷泉港实验室进行博士后研究。
要联系作者或第一作者并在JACC,CurrentBiology,NAR,JBC,Oncotarget,ScientificReprot和其他出版物上发表许多文章,请申请一系列专利。
致力于神经病学和神经科学的跨学科研究。
3D基因组测序,单个细胞测序,TRAP,甲基化测序和其他先进的高性能测序技术,以及两光子体内图像,超分辨率图像,CRISPR / Cas基因编辑,蛋白质相互作用,核酸等。现代分子生物学技术着眼于三个方向:1。
研究关于病原体入侵和免疫反应的神经系统知觉和调节。
2)
这种转化利用嗜神经病毒来检查大脑的神经回路,尤其是那些参与调节免疫系统的神经回路。
病原体与宿主细胞相互作用,以研究宿主免疫性结核分枝杆菌寄生,复发和逃逸的分子机制。
原标题:捕获消化-连接-Hi-Cisanefficiency和染色体高阶结构的经济有效方法